Este estudo visa a demostrar a efetividade das políticas de inovação em saúde, sobretudo, a partir da análise dos editais da FAPESB, PAPPE Subvenção, editais de subvenção econômica direcionados para empresas, destacando os avanços e as dificuldades no desenvolvimento do Complexo Econômico e Industrial da Saúde no Estado da Bahia, assim como o potencial do CEIS na geração de oportunidades de emprego, renda e riqueza e também de participação no PIB nacional. A metodologia para esse estudo compreendeu a análise bibliográfica sobre o tema, o papel da tecnociência como instrumento para acelerar as inovações no mundo, as legislações aprovadas sobre as políticas CT&I a nível nacional, o SUS e a potência do CEIS no PIB nacional e na geração de emprego e renda, as estruturas de CT&I no estado da Bahia e a análise dos editais do PAPPE Subvenção no período de 2008 a 2020, destacando a quantidade total de projetos aprovados e, especialmente, a de projetos de saúde, nos 9 editais realizados, a qual permite observar que o percentual dos projetos de inovação em saúde poderia ser maior, considerando o orçamento da saúde no estado e o potencial do CEIS na Bahia. O estudo demonstrou as dificuldades que os projetos de inovação tecnológica em saúde possuem, uma vez que o setor saúde é fortemente regulado e que toda a inovação em saúde, antes de ir para a comercialização, precisa da autorização das agências de regulação. Por fim, é analisada a experiência da Fundação Estatal de Saúde da Família – FESF-SUS, enquanto integrante do SUS, no desenvolvimento de inovações tecnológicas em saúde e o seu potencial de não só direcionar a busca de soluções para os problemas da saúde pública, em parceria com universidades e empresas, mas também de efetivar a inovação, dialogando com os órgãos de fomento e as agências reguladoras e, assim, contribuindo para o desenvolvimento do Complexo Econômico e Industrial da Saúde na Bahia.